Если автор сам четко указывает, что это фанфик, а не аушка, значит, следует считать не-каноном и относиться как к любому фанфику. Ничего не указывает - вполне можно считать аушкой.

Если хочется это сделать каноном, то такое явление можно назвать АУ я думаю.
Как бы свой сеттинг, но в альтернативной вселенной где в нём другие условия, а персонажи или даже события (если фанфик такого характера) те же.

Можно конечно оставить на правах фан-контента, но если в нём (фанфике) происходит что-то влияющие на оригинал/дополняющее оригинал (типа раскрытия персонажей, которые не раскрылись в оригинале потому что не были в фокусе/не было подходящих условий) то лучше подвести к первому пункту (по крайней мере я бы так сделал).

Это то, что называется "апокриф".